蛋白質控制著細胞內的所有生物體系。雖然很多蛋白質各自獨立地執行自身的功能，但絕大多數蛋白質需要與其他蛋白質相互作用才能保有完整的生物活性。通過免疫共沉淀(co-IP)、pull-down檢測、交聯、標記轉移以及Far-Western印跡分析等手段對蛋白質間相互作用進行鑒定，是理解細胞內的蛋白質功能和生物學特征的關鍵。


免疫共沉淀(Co-IP)和Pull-Down 鑒定蛋白質間相互作用時最流行的技術之一。

免疫沉淀（IP）是利用固定在磁珠或瓊脂糖樹脂等固相支持物上的特異性抗體對抗原進行小型親和純化的方法。需要從細胞或組織裂解物中分離用于免疫印跡檢測或其他檢測技術的蛋白和其他生物分子時，免疫沉淀是最常用的方法之一。